MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_015850	GGC	2	6	97363	97368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780835
2004	NC_015850	GCCA	2	8	97402	97409	25 %	0 %	25 %	50 %	340780835
2005	NC_015850	ACC	2	6	97417	97422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780835
2006	NC_015850	GCG	2	6	97469	97474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780835
2007	NC_015850	TGC	2	6	97523	97528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780835
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2022	NC_015850	GCC	2	6	98517	98522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780836
2023	NC_015850	TGC	2	6	98527	98532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780836
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2350	NC_015850	ATGAC	2	10	120744	120753	40 %	20 %	20 %	20 %	340780854
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2362	NC_015850	AAT	2	6	121496	121501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780855
2363	NC_015850	AGGAT	2	10	121656	121665	40 %	20 %	40 %	0 %	340780855
2364	NC_015850	CAA	2	6	121917	121922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780856
2365	NC_015850	TGC	2	6	121923	121928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780856
2366	NC_015850	ATG	2	6	122222	122227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780857
2367	NC_015850	CCGA	2	8	122303	122310	25 %	0 %	25 %	50 %	340780858
2368	NC_015850	GCT	2	6	122338	122343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780858
2369	NC_015850	TGG	2	6	122388	122393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780858
2370	NC_015850	CGG	2	6	122426	122431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780858
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2372	NC_015850	GCG	2	6	122504	122509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780858
2373	NC_015850	TTTTA	2	10	122512	122521	20 %	80 %	0 %	0 %	340780858
2374	NC_015850	T	7	7	122545	122551	0 %	100 %	0 %	0 %	340780858
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2377	NC_015850	TGC	2	6	123281	123286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780859
2378	NC_015850	CGG	2	6	123290	123295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780859
2379	NC_015850	GCC	2	6	123309	123314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780859
2380	NC_015850	ATG	2	6	123341	123346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780859
2381	NC_015850	CTG	2	6	123841	123846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780860
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2383	NC_015850	TGT	2	6	123900	123905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780860
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2385	NC_015850	CAGT	2	8	124064	124071	25 %	25 %	25 %	25 %	340780860
2386	NC_015850	GCT	2	6	124072	124077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780860
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2418	NC_015850	TAC	2	6	126178	126183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780864
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2430	NC_015850	ACC	2	6	126390	126395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780864
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2482	NC_015850	A	6	6	131326	131331	100 %	0 %	0 %	0 %	340780870
2483	NC_015850	GAA	2	6	131380	131385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780871
2484	NC_015850	ATCG	2	8	131389	131396	25 %	25 %	25 %	25 %	340780871
2485	NC_015850	CAT	3	9	131407	131415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871
2486	NC_015850	TGG	2	6	131529	131534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780871
2487	NC_015850	TGTGG	2	10	131592	131601	0 %	40 %	60 %	0 %	340780871
2488	NC_015850	GCT	2	6	131662	131667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780871
2489	NC_015850	TGT	2	6	131673	131678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780871
2490	NC_015850	TA	3	6	131700	131705	50 %	50 %	0 %	0 %	340780871
2491	NC_015850	GCT	2	6	131791	131796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780871
2492	NC_015850	TCA	2	6	131829	131834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871
2493	NC_015850	GA	4	8	131846	131853	50 %	0 %	50 %	0 %	340780871
2494	NC_015850	GCT	2	6	131888	131893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780871
2495	NC_015850	TCT	2	6	131932	131937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780871
2496	NC_015850	TCA	2	6	131946	131951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871
2497	NC_015850	TCC	2	6	131961	131966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780871
2498	NC_015850	GGC	2	6	132003	132008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780871
2499	NC_015850	CT	3	6	132024	132029	0 %	50 %	0 %	50 %	340780871
2500	NC_015850	TCA	2	6	132033	132038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871

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